Theo ông Nguyễn Xuân Bắc (phụ trách người cao tuổi thôn Tự Thôn, xã Nam Sơn, TP. Bắc Ninh, tỉnh Bắc Ninh), chùa Dạm được xây dựng trên mặt bằng rộng 7.500m2. Nhìn tổng thể chùa Dạm như một tòa sen.

Chùa Dạm được chia làm 4 cấp, nền chùa đều có xếp đá chống xói lở, chân hơi choãi. Đá xếp đều khai thác tại chỗ, đẽo gọt vuông vắn như viên gạch dài rộng chừng 50 cm - 60 cm.

Cấp nền thứ 2 là nền chùa chính. Đây cũng là nơi lưu giữ những di tích quan trọng nhất, đứng nhìn xuống là cảnh non nước mênh mông

Nổi bật trên nền chính là cây cột đá

Đây là một cột đá lớn nguyên khối được dựng trên bệ tròn cao 1m, đường kính khoảng 4,5m. Tổng chiều cao của cột đá là 5m.

Đoạn dưới khối trụ tròn chạm nổi là đôi rồng phong cách thời Lý với mào bốc lửa, bờm thành búi như cờ đuôi nheo bay lướt, thân tròn lẳn uốn khúc, chân năm móng.

Trên thân cột đá cũng có nhiều nét chạm trổ tinh xảo. Hiện nay, có nhiều ý kiến khác nhau về ý nghĩa của cột đá chùa Dạm. Có nhà nghiên cứu cho rằng, những cột đá này là biểu tượng sinh thực khí Linga và Yoni đã được Việt hóa, mang mơ ước mưa thuận gió hòa, đời sống ấm no thịnh trị. Có ý kiến cho rằng cột đá mang dáng dấp của cột Chùa Một Cột

Giếng Bống cũng ngự trị ở nền tầng thứ hai. Tương truyền, cô Tấm đã từng nuôi cá Bống ở giếng này.

Đường lên xuống mỗi cấp của chùa Dạm gồm 25 bậc đá

Đây trước là đền thờ 9 đời vua nhà Lý, trên lớp đá để lại vẫn còn tạc hình con rồng